Equipements

Analyse de données multiparamétriques

Logiciels : OMIQ, Cytobank, FlowJo

 

 

 

 

 

Gallios (Beckman-Coulter - Cytomètre-analyseur)

Le Gallios est équipé de 3 LASER à alignement fixe, séparés spatialement. Le banc optique de type boulevard permet une transmission de la fluorescence proche de 100% avec ses filtres de réflexion positionnés à 18°. Il permet de mesurer jusqu’à 10 paramètres de fluorescence. La cellule d’écoulement en quartz est couplée au moyen d’un gel à des lentilles de collection d’ouverture numérique de 1,2. Il est possible d’adapter l’angle de collection de la lumière diffractée à la taille des éléments analysés grâce à 2 photodiodes indépendantes. Il est ainsi possible de distinguer entre elles des particules submicrométriques (0,4 er 0,5 µm). L’enregistrement des données sur 20 bits permet des compensations de haute précision. Le passeur de tube de type carrousel permet d’analyser automatiquement jusqu’à 32 tubes. Avant chaque analyse l’échantillon est remis en suspension au moyen d’un vortex incorporé. La vitesse d’acquisition maximale est de 25 000 évènements par seconde et jusqu’à 24.106 évènements stockés par fichier (ce chiffre varie en fonction du nombre de paramètres sauvegardés).

 

Le pilotage de la station et l’acquisition des données sont réalisés avec le Kaluza.Gallios.pdf.

Télécharger le logiciel Kaluza G afin de préparer en déporter depuis votre ordinateur de laboratoire les masques de protocoles et les worklists. Attention ne fonctionne que sur PC ou Mac avec gestion Windows.

 

ATTENTION. Les analyses sur le Gallios se font uniquement en tubes de 5 ml vendus par Beckman Coulter : 2523749.

 

LASER PMT Dichroïc Filtre   Désignation
standard
Fluorochrome commun
Liste non exhaustive
488 nm Filtre 1 550 dSP 525 / 40 BP 505 - 545 FITC Alexa 488, GFP, YFP, Zombie
Green, JC-1 (monomere),
Sytox Green, TO-PRO-1
22 mW Filtre 2 595 dSP 575 / 30 BP 560 - 590 PE PE, DiOC,
DyeCycle Orange, SNARF
  Filtre 3 655 dSP 620 / 30 BP 605 - 635 PE-Texas Red PE-Texas Red, PI, DiOC
  Filtre 4 730 dSP 695 / 30 BP 680 - 710 PE - Cy5.5 PE-Cy5.5, PerCP-Cy5.5, Alexa
700, Tri-Color, 7-AAD,
  Filtre 5   755 LP   PE - Cy7 Alexa 750
638 nm Filtre 6 710 dSP 660 / 20 BP 650 - 670 APC Alexa 647, Cy5, TO-PRO-3,
Sytox Red
25 mW Filtre 7 750 dSP 725 / 20 BP 715 - 735 Alexa 700 Alexa 700
  Filtre 8   755 LP 755 LP APC - Cy7, APC-Alexa 750, APC-H7
405 nm Filtre 9 480 dSP 450 / 40 BP 430 - 470 Pacific Blue Alexa 405, PO-PRO-1,
DyeCycle Violet
40 mW Filtre 10   550 / 40 BP 530 - 570 SYTOX blue AmCyan


d : Dichroïque – LP : Long Pass – SP : Short Pass - BP : Band Pass

Imprimer tableau

MoFlo Astrios EQ (Beckman-Coulter Cytomètre-trieur)

Le MoFlo Astrios EQ est un trieur haut de gamme ultra-rapide. Il est équipé de 5 LASER fibrés (hormis le LASER U.V.) et décalés spatialement. Les émissions de fluorescences sont collectées par des fibres optiques placées en sortie de pinhole. La configuration du banc optique de type « precision Optical Device » permet de mesurer jusqu’à 16 paramètres de fluorescence. De conception « jet in air » l’Astrios peut atteindre une vitesse de tri de 70 000 évènements par seconde.
Les performances du système sont remarquables tant au niveau de la qualité de rendement et de pureté, de la vitesse d’acquisition et de tri, que de la capacité du traitement et du stockage des signaux.
Les signaux sont digitalisés à une fréquence de 100 MHz sur 32 bits (jusqu’à 100 000 évènements par seconde en analyse). En mode logarithmique, la gamme dynamique de mesure des signaux s’étend sur 5 décades (0,0001 à 10 volts). Il est possible d’activer simultanément 6 jets de tris, soit de trier six populations, selon des mode définis individuellement (single cell, pureté, enrichissement et mixte).

Le clonage single cell ultra précis (plaque 384 ou 96 puits fond conique et microvolume) se fait en tri vertical. Sort index en X et en Y.

Le module EQ permet une meilleure séparation des nanoparticules.

 

Le système est équipé d’un module de clonage.
Les supports de tubes pour l’échantillon sont multiples et il est possible de programmer son agitation.
La récupération des fractions triées dans des plaques multi-puits, sur des lames ou dans différents types de tubes s’effectue grâce à un bras robot. L’échantillon et les fractions collectées peuvent être maintenus dans un environnement où la température est régulée. Un jeu de buses de diamètre variable (50 à 200 µm) permet d’adapter le tri à la taille des évènements à analyser.

Le pilotage du trieur et l’acquisition des données sont réalisés avec le logiciel Summit 6.2.

 

Sourcesd’excitation 355 nm
Sourcesd’excitation 405 nm
Source d'excitation 488 nm
Source d’excitation 561 nm
Source d’excitation 640 nm

 

Filtres supplémentaires  

Désignation standard

Liste non exhaustive

405 / 10 BP 400 - 410 Alexa Fluor 350
513 / 26 BP 500 - 526 FITC, Alexa Fluor 488
530 / 10 BP 525 - 535 Rhodamine Green
561 / 14 BP 554 - 568 Alexa Fluor 555
592 / 08 BP 588 - 596 Rhodamine Red
642 / 10 BP 637 - 647 Alexa Fluor 633


d : Dichroïque – LP : Long Pass – SP : Short Pass - BP : Band Pass

Imprimer tableau

Laboratoire de culture

Le laboratoire de culture met à votre disposition un PSM de classe II, un incubateur à CO2 et un évier. Le service possède un réfrigérateur/ congélateur, une centrifugeuse réfrigérée et une microfuge réfrigérée. Une machine à glace est accessible à proximité.

Ces équipements sont utilisables pour entreposer momentanément du matériel biologique ou autre. Ce matériel devra être clairement identifié.

 

Stations d'analyse

Les stations d'analyse du service sont accessibles gratuitement sur réservation OpenIris.

 

Les logiciels disponibles, d'analyse des données de cytométrie, sont :

VenturiOne Version7.pdf

FlowJo Version 10.4.2

Summit Version 6

Kaluza.Analysis 1.3.pdf

Kaluza Analysis 2.1

RTCA Pro Guide

 

Le logiciel de déconvolution des phases du cycle cellulaire ou d'analyse de la prolifération : Modifit Version 3.3 est disponible sur l'ordinateur du cytomètre - analyseur LSRII. Contacter le service pour y avoir accès medecine-cisa-cytometrie@listes.sorbonne-universite.fr ou 01 40 01 13 68.